Допускается два варианта произношения слова — базИлика и базилИка.
Подтверждением этого факта служат два авторитетных словаря — «Орфоэпический словарь под редакцией Аванесова» и «Словарь иностранных слов».
Напомним, что похожая ситуация наблюдается и с ударением в слове генезис.
Речь о каком «базилике» идет? Тот который храм или растение?
В нашем примере речь идет об архитектурном термине, который обозначает тип здания.
В случае же с растением ударение ставится на последний слог — базилИк.
Мерси