В этом слове ударение падает на третий слог — автомАтия.

Словечко это, скажем так, не самое известное среди обывателей, и мало кто знает на каком слоге ставить ударение в этом слове. Исключение составляют разве только медики, ведь слово это — часть их профессиональной терминологии.

Автоматия (от греч. automates — «самодействующий», «самопроизвольный»), многозначный термин: 1) в физиологии бессознательное, не зависящее от воли движение; 2) способность клеток сердца давать импульс к ритмичному сокращению мышц без каких-либо внешних воздействий; 3) в философии способность приближаться или удаляться от известных предметов.

Запомните, что ударение в этом слове падает на третий слог (а — вто — мА — ти — я).

Пример использования слова автоматия с правильным ударением:

Автоматия сердца — загадка для тех, кто не связан с медицинской наукой.
Ножное сердце паука-сенокосца обладает реактивной ритмикой и сокращается ритмически, но не обладает автоматией.
Автоматия некоторых органов или клеток может проявляться только при определенной кислотности, ионном составе, температуре, степени растяжения ткани и т. д.